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基因密碼揭示:吸煙與飲酒如何影響你的心跳節(jié)奏

發(fā)布時(shí)間:  2025-03-17 15:17:26


2025年3月4日,《Clin Epigenetics.》刊登了一項(xiàng)中國(guó)學(xué)者的孟德?tīng)栯S機(jī)化(MR)研究論文,探討了吸煙和飲酒與心電圖(ECG)信號(hào)的因果關(guān)系。該研究通過(guò)雙樣本MR分析,利用遺傳變異作為工具變量,排除了傳統(tǒng)觀察性研究中的混雜偏倚,得出了一系列重要發(fā)現(xiàn)。



摘要

背景

吸煙和飲酒已被公認(rèn)為心臟病的風(fēng)險(xiǎn)因素,然而,它們對(duì)ECG信號(hào)的因果影響及其潛在機(jī)制仍不清楚。既往研究可能受到混雜因素或偏倚的影響,因此本研究解析了吸煙和飲酒與P波時(shí)程、PR間期及QT間期之間的遺傳結(jié)構(gòu)關(guān)聯(lián)。

方法

本研究利用吸煙和飲酒的遺傳工具變量、相關(guān)的甲基化數(shù)量性狀位點(diǎn)(mQTL)及ECG指數(shù)的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)匯總數(shù)據(jù),采用連鎖不平衡評(píng)分回歸(LD Score Regression)和MR分析評(píng)估遺傳力及遺傳因果關(guān)聯(lián)。此外,通過(guò)共定位分析(colocalization analysis)和基于匯總數(shù)據(jù)的孟德?tīng)栯S機(jī)化(SMR)進(jìn)行精細(xì)定位,以識(shí)別潛在的共享遺傳變異。

結(jié)果

研究發(fā)現(xiàn),每周飲酒量(Drinks per week, DrnkWk)與QT間期之間存在正向因果關(guān)系[β(95%CI):1.06(0.91, 5.05),P?=?0.005],且該因果關(guān)系在多種MR模型中均得到驗(yàn)證。多變量MR分析進(jìn)一步確認(rèn)了該關(guān)聯(lián)獨(dú)立于吸煙表型。在表觀遺傳MR分析中,兩個(gè)酒精相關(guān)的CpG位點(diǎn)(cg03345232和cg04605617)與QT間期變化存在因果關(guān)系,其中cg04605617定位于PLA2G2C基因,顯著延長(zhǎng)QT間期。此外,mQTL rs10916683(位于cg04605617)是PLA2G2C的強(qiáng)eQTL。共定位分析顯示,cg03345232與QT間期易感性共享一個(gè)因果變異(rs12881206)。然而,SMR分析未能在DrnkWk與QT間期之間識(shí)別出通過(guò)HEIDI檢驗(yàn)的共享功能基因。

結(jié)論

DrnkWk與QT間期延長(zhǎng)之間存在因果關(guān)系,針對(duì)特定DNA甲基化位點(diǎn)(如定位于PLA2G2C的cg04605617)可能為預(yù)防QT間期延長(zhǎng)提供新的潛在靶點(diǎn)。




結(jié)果

飲酒、吸煙與ECG遺傳風(fēng)險(xiǎn)效應(yīng)

在TSMR分析前,我們使用Burgess等人的工具評(píng)估樣本重疊帶來(lái)的偏倚與I型錯(cuò)誤率(0.05),偏倚為0.000,確保估算可靠性。

MR分析中,所有工具變量的F統(tǒng)計(jì)量為30.68–790.45,保證工具變量效力。IVW分析結(jié)果:

問(wèn)題性飲酒與P波持續(xù)時(shí)間延長(zhǎng)相關(guān) [β=11.64 (8.25, 15.03), P=1.76E-11]。

開(kāi)始吸煙與PR間期縮短相關(guān) [β=-1.23 (-2.12, -0.33), P=0.007]。

酒精使用障礙、DrnkWk、開(kāi)始吸煙均與QT間期延長(zhǎng)相關(guān)。

加權(quán)中位數(shù)和徑向IVW支持IVW分析結(jié)果,但問(wèn)題性飲酒與P波持續(xù)時(shí)間的因果關(guān)系未通過(guò)MR-Egger假設(shè)檢驗(yàn)。開(kāi)始吸煙與PR間期間存在微弱相關(guān)性,但未獲其他方法支持。

MVMR調(diào)整日吸煙量和開(kāi)始吸煙后,DrnkWk仍與QT延長(zhǎng)相關(guān),MR-Egger截距檢驗(yàn)及MR-RAPS分析排除定向水平多效性(P>0.05)。

敏感性分析證實(shí)MR研究穩(wěn)健性:

留一法:無(wú)單一SNP顯著影響,IVW未檢出異質(zhì)性(P=0.061)。

MR-RAPS診斷分析顯示IVs與殘差獨(dú)立(P=0.221)。

殘差圖與Q-Q圖支持正態(tài)性假設(shè)。

飲酒與QT間期易感性的共享遺傳基礎(chǔ)

Bayes factor共定位分析表明,GoDMC數(shù)據(jù)庫(kù)中的cg03345232位點(diǎn)甲基化水平與QT GWAS信號(hào)共享rs12881206(PPH4=99.7%),而cg04605617未發(fā)現(xiàn)顯著共定位變異。

SMR分析結(jié)合eQTL與GWAS數(shù)據(jù),探索DrnkWk與QT間期的功能基因:

全血eQTL:77個(gè)DrnkWk相關(guān)變異,33個(gè)QT相關(guān)變異(P<3.20E-06)。

左心室eQTL:19個(gè)QT相關(guān)顯著變異(P<1.07E-05)。

NPIPB6(蛋白編碼基因)與NONHSAG018995.2(長(zhǎng)非編碼RNA)可能介導(dǎo)DrnkWk與QT的關(guān)系,但HEIDI測(cè)試未通過(guò)(P<0.05),提示水平多效性影響。



研究方法

研究設(shè)計(jì)

本研究探討吸煙、飲酒對(duì)ECG的遺傳影響,選取五種暴露表型:

飲酒:DrnkWk(每周飲酒量)、AUD(酒精使用障礙)、PAU(問(wèn)題性飲酒)。

吸煙:CigDay(日吸煙量)、SmkInit(開(kāi)始吸煙)。

ECG結(jié)局指標(biāo)包括PWD、PR間期、QT間期,QT延長(zhǎng)與心律失常及猝死(SCD)密切相關(guān),QRS因統(tǒng)計(jì)效能未納入分析。

遺傳分析方法

LDSC 評(píng)估遺傳力(h2)及遺傳相關(guān)性(rg)。

MR分析

TSMR:雙樣本孟德?tīng)栯S機(jī)化分析。

MVMR:控制吸煙與飲酒的遺傳交叉影響(|rg|=0.16–0.27)。

mQTL-MR:探索DNA甲基化在QT間期調(diào)控中的作用,并結(jié)合共定位分析評(píng)估潛在機(jī)制。

基因表達(dá)路徑分析通過(guò)SMR結(jié)合全血與心臟eQTL數(shù)據(jù),HEIDI測(cè)試排除水平多效性。

GWAS數(shù)據(jù)來(lái)源

吸煙/飲酒:GSCAN(n=2,669,029)、FinnGen(AUD, n=376,477)、MVP GWAS Meta(PAU, n=435,563)。

ECG:CVDKP(PR間期, n=271,570)、UKB Meta(QT間期, n=84,630)、GCST004826(PWD, n=37,678)。

統(tǒng)計(jì)分析

LDSC計(jì)算SNP遺傳力(h2)及跨表型遺傳相關(guān)性(rg)。

MR分析

IVW:主效應(yīng)分析,假設(shè)所有SNP均為有效IVs。

穩(wěn)健性分析:MR-Egger、加權(quán)中位數(shù)、徑向MR、MR-RAPS,徑向圖檢測(cè)異常值。

水平多效性控制:Egger截距檢驗(yàn)、MR-RAPS診斷。

敏感性分析:異質(zhì)性評(píng)估、留一法分析。

DNA甲基化MR分析

Wald比值法(單mQTL),IVW(多mQTL)。

共定位分析:Bayes因子評(píng)估因果變異,coloc計(jì)算H4后驗(yàn)概率(>95%視為共定位證據(jù))。

SMR基因表達(dá)分析 結(jié)合GWAS與eQTL數(shù)據(jù),Bonferroni校正(P<0.05/探針數(shù))確定顯著性,HEIDI測(cè)試排除水平多效性。



小結(jié)

本研究利用孟德?tīng)栯S機(jī)化方法探討吸煙、飲酒對(duì)心電圖指標(biāo)的遺傳影響,結(jié)果表明問(wèn)題性飲酒與P波持續(xù)時(shí)間延長(zhǎng)相關(guān),開(kāi)始吸煙與PR間期縮短相關(guān),酒精使用障礙、每周飲酒量、開(kāi)始吸煙均可導(dǎo)致QT間期延長(zhǎng)。MVMR分析確認(rèn)每周飲酒量與QT間期的因果關(guān)系,并排除水平多效性影響。共定位分析顯示cg03345232位點(diǎn)的DNA甲基化水平與QT GWAS信號(hào)共享rs12881206,SMR分析進(jìn)一步揭示NPIPB6和NONHSAG018995.2可能介導(dǎo)每周飲酒量對(duì)QT的影響。整體而言,本研究提供了吸煙、飲酒對(duì)心電圖參數(shù)影響的遺傳證據(jù),并揭示潛在的分子機(jī)制,有助于理解其心臟電生理效應(yīng)。




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